MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome

Total Repeats: 72597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002942	TAA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002942	TA	3	6	16	21	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002942	ATTT	2	8	30	37	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002942	TTA	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002942	TA	3	6	42	47	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002942	A	7	7	72	78	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002942	ATTT	2	8	142	149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002942	TC	3	6	162	167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002942	AAAT	2	8	230	237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002942	ATTTT	2	10	246	255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002942	TTA	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002942	AAT	2	6	305	310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002942	TATT	2	8	340	347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002942	ATTTA	2	10	364	373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002942	ATT	2	6	379	384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002942	TGTA	2	8	385	392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002942	TAT	2	6	410	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002942	A	8	8	507	514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002942	TTA	2	6	536	541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002942	TTA	2	6	546	551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002942	GATA	2	8	599	606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002942	ACT	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840257
23	NC_002942	TTG	2	6	687	692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840257
24	NC_002942	AGC	2	6	757	762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840257
25	NC_002942	TTA	2	6	771	776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840257
26	NC_002942	TCGTT	2	10	785	794	0 %	60 %	20 %	20 %	52840257
27	NC_002942	T	8	8	815	822	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
28	NC_002942	GTAG	2	8	885	892	25 %	25 %	50 %	0 %	52840257
29	NC_002942	CTG	2	6	919	924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840257
30	NC_002942	A	6	6	972	977	100 %	0 %	0 %	0 %	52840257
31	NC_002942	TAAA	2	8	1003	1010	75 %	25 %	0 %	0 %	52840257
32	NC_002942	A	6	6	1008	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	52840257
33	NC_002942	TTAT	3	12	1110	1121	25 %	75 %	0 %	0 %	52840257
34	NC_002942	G	7	7	1122	1128	0 %	0 %	100 %	0 %	52840257
35	NC_002942	CATG	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	52840257
36	NC_002942	AAT	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840257
37	NC_002942	GTATT	2	10	1200	1209	20 %	60 %	20 %	0 %	52840257
38	NC_002942	TTG	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840257
39	NC_002942	CAAA	2	8	1251	1258	75 %	0 %	0 %	25 %	52840257
40	NC_002942	TGA	2	6	1310	1315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840257
41	NC_002942	T	6	6	1323	1328	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
42	NC_002942	T	6	6	1356	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
43	NC_002942	TTGG	2	8	1465	1472	0 %	50 %	50 %	0 %	52840257
44	NC_002942	CG	3	6	1510	1515	0 %	0 %	50 %	50 %	52840257
45	NC_002942	ATTA	2	8	1523	1530	50 %	50 %	0 %	0 %	52840257
46	NC_002942	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
47	NC_002942	TCT	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840257
48	NC_002942	AGTT	2	8	1723	1730	25 %	50 %	25 %	0 %	52840257
49	NC_002942	A	6	6	1747	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	52840257
50	NC_002942	TAAAG	2	10	1769	1778	60 %	20 %	20 %	0 %	52840257
51	NC_002942	AATGGC	2	12	1832	1843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52840257
52	NC_002942	GGT	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52840257
53	NC_002942	GAT	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840257
54	NC_002942	TCT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840257
55	NC_002942	A	6	6	2044	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	52840258
56	NC_002942	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840258
57	NC_002942	T	6	6	2124	2129	0 %	100 %	0 %	0 %	52840258
58	NC_002942	AAAAC	2	10	2325	2334	80 %	0 %	0 %	20 %	52840258
59	NC_002942	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840258
60	NC_002942	TAG	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840258
61	NC_002942	ATG	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840258
62	NC_002942	TTG	2	6	2431	2436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840258
63	NC_002942	CAG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840258
64	NC_002942	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
65	NC_002942	ATT	2	6	2524	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
66	NC_002942	TAA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840258
67	NC_002942	CAAA	2	8	2593	2600	75 %	0 %	0 %	25 %	52840258
68	NC_002942	A	6	6	2614	2619	100 %	0 %	0 %	0 %	52840258
69	NC_002942	ATT	2	6	2631	2636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
70	NC_002942	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
71	NC_002942	TTG	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840258
72	NC_002942	CAAT	2	8	2709	2716	50 %	25 %	0 %	25 %	52840258
73	NC_002942	AATT	2	8	2732	2739	50 %	50 %	0 %	0 %	52840258
74	NC_002942	AG	3	6	2776	2781	50 %	0 %	50 %	0 %	52840258
75	NC_002942	ATTG	2	8	2800	2807	25 %	50 %	25 %	0 %	52840258
76	NC_002942	TTG	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840258
77	NC_002942	ACA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840258
78	NC_002942	AAT	3	9	2911	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840258
79	NC_002942	AAG	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840258
80	NC_002942	TGA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840258
81	NC_002942	ATT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
82	NC_002942	ATT	2	6	3303	3308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
83	NC_002942	ACG	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840259
84	NC_002942	CA	3	6	3392	3397	50 %	0 %	0 %	50 %	52840259
85	NC_002942	TAC	2	6	3425	3430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840259
86	NC_002942	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
87	NC_002942	GCTT	2	8	3517	3524	0 %	50 %	25 %	25 %	52840259
88	NC_002942	GTT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840259
89	NC_002942	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
90	NC_002942	TTA	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
91	NC_002942	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	52840259
92	NC_002942	AT	3	6	3751	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	52840259
93	NC_002942	A	6	6	3791	3796	100 %	0 %	0 %	0 %	52840259
94	NC_002942	GGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52840259
95	NC_002942	TGATAG	2	12	3836	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840259
96	NC_002942	A	7	7	3848	3854	100 %	0 %	0 %	0 %	52840259
97	NC_002942	TA	3	6	3856	3861	50 %	50 %	0 %	0 %	52840259
98	NC_002942	CT	3	6	3927	3932	0 %	50 %	0 %	50 %	52840259
99	NC_002942	ACA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840259
100	NC_002942	A	6	6	3943	3948	100 %	0 %	0 %	0 %	52840259
101	NC_002942	TGA	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840259
102	NC_002942	GCT	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840259
103	NC_002942	TTAA	2	8	4056	4063	50 %	50 %	0 %	0 %	52840259
104	NC_002942	AAC	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840259
105	NC_002942	AAT	2	6	4116	4121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840259
106	NC_002942	GTTT	2	8	4147	4154	0 %	75 %	25 %	0 %	52840259
107	NC_002942	ATT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002942	AATGCA	2	12	4257	4268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_002942	TCA	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002942	A	8	8	4358	4365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002942	AAT	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002942	GAT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002942	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002942	ATA	2	6	4462	4467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002942	TGA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
116	NC_002942	ATA	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840260
117	NC_002942	GAT	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
118	NC_002942	CAT	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840260
119	NC_002942	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
120	NC_002942	GAA	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
121	NC_002942	GCT	2	6	4758	4763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840260
122	NC_002942	TGA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
123	NC_002942	AGA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
124	NC_002942	CA	3	6	4982	4987	50 %	0 %	0 %	50 %	52840260
125	NC_002942	TGA	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
126	NC_002942	A	6	6	5121	5126	100 %	0 %	0 %	0 %	52840260
127	NC_002942	GGC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52840260
128	NC_002942	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840260
129	NC_002942	TAAA	2	8	5173	5180	75 %	25 %	0 %	0 %	52840260
130	NC_002942	GTT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840260
131	NC_002942	ATG	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
132	NC_002942	AAC	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840260
133	NC_002942	TGG	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52840260
134	NC_002942	AGC	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
135	NC_002942	AAT	2	6	5367	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840260
136	NC_002942	TGA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
137	NC_002942	CAG	2	6	5527	5532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
138	NC_002942	GCA	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
139	NC_002942	ATT	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840260
140	NC_002942	GCA	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
141	NC_002942	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	52840260
142	NC_002942	GCG	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52840260
143	NC_002942	CTG	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840260
144	NC_002942	TCT	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840260
145	NC_002942	AAG	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
146	NC_002942	ATC	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840260
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148	NC_002942	AG	3	6	6042	6047	50 %	0 %	50 %	0 %	52840260
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152	NC_002942	GAT	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
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164	NC_002942	CTCG	2	8	6937	6944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_002942	CT	3	6	6955	6960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_002942	ACTTA	2	10	6985	6994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_002942	CTA	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_002942	TGA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_002942	A	7	7	7019	7025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_002942	TGAT	2	8	7032	7039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_002942	A	7	7	7050	7056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_002942	TGC	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_002942	AAG	2	6	7248	7253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_002942	TAAT	2	8	7746	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	52840261
183	NC_002942	AACA	2	8	7806	7813	75 %	0 %	0 %	25 %	52840261
184	NC_002942	ACC	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52840261
185	NC_002942	TTA	2	6	7909	7914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840261
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194	NC_002942	AG	3	6	8380	8385	50 %	0 %	50 %	0 %	52840262
195	NC_002942	TAAT	2	8	8412	8419	50 %	50 %	0 %	0 %	52840262
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201	NC_002942	CATT	2	8	8861	8868	25 %	50 %	0 %	25 %	52840262
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242	NC_002942	T	6	6	11355	11360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_002942	A	6	6	11393	11398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_002942	TTA	2	6	11434	11439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_002942	A	6	6	11560	11565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_002942	GCT	2	6	11606	11611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_002942	T	8	8	12610	12617	0 %	100 %	0 %	0 %	52840264
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273	NC_002942	TTA	2	6	12882	12887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_002942	TCA	2	6	12890	12895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_002942	TTGA	2	8	12926	12933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
276	NC_002942	TAT	2	6	12983	12988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_002942	AATA	2	8	12998	13005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_002942	AAC	2	6	13041	13046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_002942	TAC	2	6	13075	13080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840265
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293	NC_002942	TTTA	2	8	13979	13986	25 %	75 %	0 %	0 %	52840266
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399	NC_002942	TC	3	6	19581	19586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
400	NC_002942	GA	3	6	19590	19595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
401	NC_002942	TGT	2	6	19604	19609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
402	NC_002942	T	6	6	19721	19726	0 %	100 %	0 %	0 %	52840271
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406	NC_002942	ATTT	2	8	19797	19804	25 %	75 %	0 %	0 %	52840271
407	NC_002942	TGT	2	6	19837	19842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840271
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472	NC_002942	TTA	2	6	23250	23255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840274
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